Рецептор активатора плазминогена урокиназного типа (uPAR) гиперэкспрессируется при различных злокачественных опухолях и ассоциирован с инвазией, метастазированием и агрессивным течением. Пептиды, селективно связывающиеся с такими опухоль-ассоциированными белками, рассматриваются как перспективные кандидаты для молекулярной визуализации и направленной доставки терапевтических агентов. В данном исследовании применён оптимизированный протокол биопэннинга с использованием секвенирования нового поколения (NGS) и дополнительных контролей отбора для идентификации uPAR-связывающих пептидов из фаговой библиотеки.

Три пептида-кандидата были отобраны для дальнейшей оценки с помощью комплементарных методов: проточной цитометрии и количественного планшетного анализа. Оптимизированная процедура включает меры по снижению (но не полному исключению) обогащения пептидами, не связанными с целевым белком, а также валидацию in vitro. Различия, выявленные между методами валидации, подчеркнули важность использования комплементарных подходов для оценки пептидов-кандидатов.

Идентифицированные пептиды представляют собой многообещающие кандидаты для дальнейшей оптимизации в направлении молекулярной визуализации и таргетных терапевтических применений при uPAR-позитивных опухолях. Исследование демонстрирует ценность сочетания оптимизированного фагового дисплея с NGS и комплексом валидационных методов для выявления специфичных пептидов.