Команда Kevin J. Liu из Стэнфордского университета применила метод uRARE-seq (urine Random priming and Affinity capture of cfRNA fragments for Enrichment analysis by sequencing) — жидкостную биопсию для профилирования внеклеточной РНК мочи — к 683 образцам мочи пациентов с раком и контрольной группы. Внеклеточная РНК мочи содержала транскрипты мочеполовых тканей и опухолевые транскрипты у пациентов с раком предстательной железы, почки или мочевого пузыря.
При 90% специфичности для выявления локализованного рака мочевого пузыря uRARE-seq показал 95% чувствительность. Метод превзошёл анализ опухолевой ДНК мочи и не зависел от наличия field-effect мутаций. Анализ внеклеточной РНК мочи чувствительно выявлял минимальную остаточную болезнь, а также различал полный молекулярный ответ после операции и после интравезикальной терапии вакциной БЦЖ (Bacillus Calmette-Guérin).
У пациентов с полным ответом на БЦЖ в предлечебной моче были обогащены T-клеточные и другие иммунные сигнатуры, что указывает на предсуществующий противоопухолевый иммунный ответ; у неответивших отмечена более высокая экспрессия генов, связанных с пролиферацией. Это биологическое различие позволило разработать биомаркер, предсказывающий вероятность ответа на БЦЖ по сравнению с химиотерапией в предлечебной моче у 114 пациентов с площадью под кривой (AUC) 0,93, что тесно ассоциировано с риском рецидива.
«Анализ внеклеточной РНК мочи с использованием uRARE-seq обеспечивает чувствительную детекцию и молекулярную характеристику рака мочевого пузыря, открывая возможности для скрининга, выявления минимальной остаточной болезни и предсказания ответа на адъювантную терапию», — заключили авторы.