Cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4 (CNIH4) стабильно гиперэкспрессировался в образцах плоскоклеточного рака головы и шеи (HNSCC) по сравнению с нормальными тканями в трёх независимых когортах. В транскриптомном датасете TCGA-HNSC площадь под ROC-кривой (AUC) для разграничения опухолевой и нормальной ткани составила 0.915. Повышенная экспрессия CNIH4 ассоциировалась с неблагоприятными клинико-патологическими характеристиками и укорочением общей выживаемости, опухолево-специфической выживаемости, безрецидивного интервала и времени до прогрессирования.
Прогностическая номограмма, включающая CNIH4, показала умеренную предиктивную способность: AUC составила 0.710, 0.750 и 0.720 для 1-, 3- и 5-летней выживаемости соответственно. Высокий уровень CNIH4 был связан с особыми паттернами мутаций, более высоким мутационным бременем опухоли (TMB), а также различиями в иммунных и стромальных сигнатурах и экспрессии иммунорегуляторных генов. Экспрессия CNIH4 коррелировала с более низкими предсказанными значениями IC50 для fluorouracil, tegafur, paclitaxel и nilotinib.
В экспериментах на клеточных линиях орального плоскоклеточного рака SAS и SCC-9 нокдаун CNIH4 с помощью двух независимых siРНК приводил к снижению пролиферации, клоногенности и скорости заживления раны. RNA-секвенирование после нокдауна CNIH4 выявило изменения в экспрессии генов, связанных с эпителиально-мезенхимальным переходом, интерфероновой сигнализацией, сигнальными путями TNF-α/NF-κB, NOTCH, p53-ассоциированными программами и ответом на неправильно свёрнутые белки.
Исследование указывает на ассоциацию CNIH4 с фенотипами прогрессии HNSCC и клиническими исходами. Функциональные и транскриптомные данные поддерживают связь CNIH4 со злокачественными характеристиками орального плоскоклеточного рака и обосновывают дальнейшее изучение его прогностического и терапевтического значения.