Исследователи проанализировали транскриптомные профили 502 образцов от 497 пациентов с раком предстательной железы. Методом дифференциальной экспрессии генов, ассоциированной с ImmuneScore, и взвешенного анализа коэкспрессии генов выявили общие гены, которые сравнили с четырьмя функциональными генными наборами. Экспрессию FLT3 изучили в контексте иммунных сигнатур и проанализировали на уровне одиночных клеток. Эффекты нокдауна FLT3 двумя независимыми siRNA оценили в клеточных линиях DU145 и 22Rv1.
Скрининг выявил 64 общих гена; сравнение с функциональными наборами приоритезировало FLT3 и AIM2. Экспрессия FLT3 ассоциировалась с несколькими сигнатурами иммунных клеток: корреляции с общими Т-клеточными и В-клеточными сигнатурами были сильнее, чем с сигнатурой CD8-положительных Т-клеток. Анализ на уровне одиночных клеток указал на экспрессию FLT3 в клетках, аннотированных как моноциты.
В клеточных линиях DU145 и 22Rv1 обе FLT3-таргетные siRNA снижали рост и колониеобразование, уменьшали миграцию и инвазию в тесте Transwell и изменяли маркеры эпителиально-мезенхимального перехода.
Результаты анализа тканей подтверждают связь экспрессии FLT3 с иммунными транскрипционными сигналами при раке простаты. Однако данные клеточных линий описывают отдельный фенотип in vitro и не устанавливают, как FLT3 связан с лимфоцитарной инфильтрацией. Авторы подчеркивают, что работа не доказывает причинно-следственный иммунорегуляторный механизм и прогностическую значимость FLT3.