Одноцентровое исследование включило 20 пациентов с рецидивирующим раком мочевого пузыря. Проведено RNA-секвенирование образцов опухолевой ткани с определением молекулярных подтипов EU, иммунных подтипов, PD-L1- и HER2-статуса. Выполнен функциональный анализ обогащения (GO, KEGG, Reactome). Пациенты разделены на группы MAGEA4-высокой и MAGEA4-низкой экспрессии по медиане когорты.
Идентифицированы 20 генов с наиболее выраженными различиями экспрессии между подтипами. Гены, гиперэкспрессированные в Luminal papillary подтипе, обогащены терминами, связанными с межклеточными контактами и поддержанием эпителиальной структуры. Подавленные гены обогащены путями иммунной активации и воспалительной инфильтрации. Выявлены сигналы обогащения путей PI3K-Akt, MAPK, нейроактивного лиганд-рецепторного взаимодействия и JAK-STAT.
Обнаружены значимые различия в PD-L1-статусе, подтипах TMIT и EU между группами MAGEA4-высокой и MAGEA4-низкой экспрессии. Шесть тестов на ассоциацию MAGEA4 с иммунными и молекулярными признаками сохранили значимость q<0,05 после коррекции Бенджамини-Хохберга. Экспрессия MAGEA4 также различалась в зависимости от PD-L1-статуса, подтипа TMIT и бинарной группировки подтипов EU.
Внутрикогортный ROC-анализ для дискриминации клинической пользы показал AUC 0,798 в общей когорте, 0,800 в когорте иммунотерапии и 0,750 в когорте комбинированной терапии; AUC с поправкой на оптимизм методом бутстрэпа составила 0,793. Высокая экспрессия MAGEA4 ассоциирована с более короткой выживаемостью без прогрессирования. Результаты обосновывают дальнейшую валидацию MAGEA4 как кандидата в маркеры молекулярной стратификации в независимых когортах.