Саркомы — редкие гетерогенные злокачественные опухоли, для которых надёжные биомаркеры продольного мониторинга заболевания остаются ограниченными. Циркулирующая опухолевая ДНК (ctDNA) зарекомендовала себя как минимально инвазивный биомаркер при нескольких солидных опухолях, но её клиническое применение при саркомах остаётся недостаточно определённым из-за биологической гетерогенности, вариабельности выделения ctDNA и ограниченной доступности рекуррентных геномных альтераций, покрываемых панелями, среди различных подтипов.
Авторы провели ретроспективное исследование реальной практики у пациентов с саркомами костей и мягких тканей, получавших лечение в сертифицированном центре. Пациентам выполнялось молекулярное профилирование опухоли и нормальной ткани для идентификации опухоль-специфичных мишеней ctDNA. Продольный мониторинг плазмы проводился с использованием таргетного секвенирования на основе уникальных молекулярных идентификаторов (UMI) у пациентов с идентифицируемой мишенью. Результаты ctDNA сравнивались с радиологической оценкой, ответом на лечение и клиническими исходами.
Из 20 скринированных пациентов у 14 (70%) была идентифицирована опухоль-специфичная мишень ctDNA, и они были включены в продольный анализ. Проанализировано 67 продольных образцов плазмы (медиана 4 образца на пациента, диапазон 2–10). В анализ согласованности включено 67 парных оценок «жидкая биопсия–радиология».
Согласованные оценки наблюдались в 59 из 67 случаев (88,1%), что соответствует существенному согласию между ctDNA и визуализацией (каппа Коэна κ = 0,755; 95% ДИ 0,598–0,913). При использовании радиологической оценки как референсного стандарта ctDNA продемонстрировала чувствительность 80,0% и специфичность 94,6% для выявления прогрессирующего заболевания. Эти оценки были описательными и не учитывали повторные измерения внутри пациентов.
Дескриптивный обзор продольной динамики ctDNA выявил паттерны, согласующиеся с радиологическим и клиническим течением заболевания у отдельных пациентов. В 3-месячном ландмарк-анализе пациенты с прогрессированием по ctDNA имели численно более короткую выживаемость без прогрессирования по сравнению с пациентами без прогрессирования по ctDNA (9,0 vs 16,0 месяцев), хотя различие не достигло статистической значимости. Исследовательский полногеномный анализ минимальной остаточной болезни (MRD) был согласован с радиологическим течением заболевания у двух отобранных пациентов.
Опухоль-специфичный мониторинг ctDNA был выполним у 70% скринированных пациентов и показал высокую согласованность с радиологической оценкой заболевания в этой когорте реальной практики. Результаты поддерживают проспективную оценку ctDNA как дополнения к визуализации для продольного мониторинга заболевания у пациентов с подходящей опухоль-специфичной мишенью, в то время как для пациентов, чьи опухоли недостаточно покрываются предопределёнными таргетными панелями, могут потребоваться более широкие опухоль-специфичные подходы.

