Исследователи разработали методологию анализа клеток костного мозга при минимальной остаточной болезни (МОБ) в ремиссии острого миелоидного лейкоза, основанную на распределении клеток по стадиям созревания в основных гемопоэтических линиях. В качестве системы координат использовали атлас BoneMarrowMap (263 159 эталонных клеток, 24 типа). Каждую клетку образца костного мозга пациента с МОБ сравнивали с наиболее вероятным нормальным аналогом и относили к стадии дифференцировки одной из пяти линий: миелоидной, эритроидной, В-клеточной, Т-клеточной/NK или дендритной. Состав костного мозга представляли набором гистограмм по стадиям дифференцировки в сравнении с четырьмя эталонными популяциями (здоровый контроль, ОМЛ при первичной диагностике, МОБ перед рецидивом, МОБ в устойчивой ремиссии) с использованием расстояний, нормированных на неопределённость классификатора, и коэффициента согласованности соседних стадий τ NN.

Подход применили к 47 пациентам с ремиссией ОМЛ из четырёх независимых когорт (Ennis и соавт., 2023; Lambo и соавт., 2023; Naldini и соавт., 2023; Beneyto-Calabuig и соавт., 2023; данные через сводный ресурс Zeng и соавт., 2025). Из них 28 впоследствии рецидивировали, а 19 оставались в устойчивой ремиссии. Комбинированный набор признаков показал площадь под ROC-кривой (AUC) 0,95 при перекрёстной валидации методом исключения одного объекта, 0,93 при исключении двух объектов и 0,92 при повторных стратифицированных разбиениях 70/30.

Доминирующим биологическим сигналом оказалась степень зрелости клеточных линий. Пациенты, у которых развился рецидив ОМЛ, в период ремиссии имели более высокую долю терминально дифференцированных клеток во всех линиях, особенно плазмоцитоидных дендритных клеток и моноцитов, по сравнению с пациентами с устойчивой ремиссией. Напротив, у пациентов с устойчивой ремиссией обнаруживалась более высокая доля примитивных клеток в миелоидной ткани, а состав костного мозга по стадиям дифференцировки больше соответствовал таковому у здоровых лиц. Эти профили созревания можно получить с использованием стандартного одноклеточного RNA-секвенирования и общедоступных баз данных.