Концентрация ДНК в парафиновых блоках рака шейки матки значимо снижается с увеличением срока хранения. При хранении более 5 лет наблюдается критическое падение концентрации ДНК на 98% (p<0,01), что достигает пороговых значений для проведения молекулярно-генетических исследований.
В исследование включены 62 образца рака шейки матки, разделенные на три группы по срокам хранения парафиновых блоков:
- 1-я группа: 0—5 лет
- 2-я группа: 5—8 лет
- 3-я группа: 8—10 лет
Выделение ДНК проводилось с использованием коммерческого набора (ООО «БиоЛинк», Россия). Оценка количества выделенной ДНК гена HER2/neu осуществлялась методом ПЦР в режиме реального времени с набором Real-time-PCR-HER2/neu согласно инструкции производителя.
Концентрация ДНК по группам:
- 0—5 лет: 10.00 нг/мкл [2,70—10.00]
- 5—8 лет: 0,20 нг/мкл [0,20—0,40] (p=0,019631)
- 8—10 лет: 0,20 нг/мкл [0,20—0,20] (p=0,000003)
Концентрация ДНК в образцах, хранящихся 0—5 лет, статистически значимо превышает значения для более длительных сроков хранения. Между группами 5—8 лет и 8—10 лет значимых различий не выявлено.
При сравнении групп со сроками хранения 0—5 лет и более 5 лет выявлено снижение концентрации ДНК на 9,80 нг/мкл (98%) с высоким уровнем значимости (p<0,01).
Полученные данные имеют критическое значение для планирования ретроспективных молекулярно-генетических исследований. Снижение концентрации ДНК до пороговых значений при хранении парафиновых блоков более 5 лет может существенно ограничить возможности проведения качественного анализа и получения достоверных результатов.