Анализ распределения клеток костного мозга по стадиям дифференцировки в пяти гемопоэтических линиях с использованием атласа BoneMarrowMap позволил с AUC 0,92–0,95 различить МОБ перед рецидивом и устойчивую ремиссию ОМЛ у 47 пациентов. Ключевой признак — повышенная доля терминально дифференцированных клеток (особенно плазмоцитоидных дендритных клеток и моноцитов) у пациентов перед рецидивом, тогда как устойчивая ремиссия характеризуется сохранением примитивных миелоидных клеток и профилем, близким к здоровому костному мозгу.

Исследователи разработали Nextflow-инструмент metafactory для data-driven идентификации метапрограмм экспрессии генов в данных scRNA-seq. Метод применён к Single-cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) — ресурсу, содержащему >700 образцов >50 типов детских опухолей, и позволяет автоматически выбирать оптимальное число кластеров на основе неизбыточности, разнообразия образцов и биологической интерпретируемости программ.

Обзор современных технологий секвенирования метилирования ДНК в одиночных клетках (scDNAme) и их революционного влияния на понимание внутриопухолевой гетерогенности, позволяющих идентифицировать редкие клональные популяции, управляющие инициацией опухоли, метастазированием и лекарственной резистентностью.