Рак представляет собой внутренне гетерогенное заболевание, характеризующееся различными злокачественными субклонами, определяемыми специфическими генетическими и эпигенетическими изменениями, включая аберрантное метилирование ДНК. Традиционные методы массового секвенирования анализируют крупные популяции клеток в совокупности, давая усредненный сигнал метилома, который маскирует редкие, но клинически значимые эпигенетические паттерны, управляющие инициацией опухоли, метастазированием и терапевтической резистентностью.

Появление секвенирования метилирования ДНК в одиночных клетках (scDNAme) привело к парадигмальному сдвигу в онкологии, обеспечивая разрешение, необходимое для расшифровки внутриопухолевой гетерогенности. Профилируя эпигеном отдельных клеток, анализ scDNAme позволяет:

• Обнаруживать новые аберрантные паттерны
• Точно реконструировать клеточные линии
• Характеризовать специфические популяции — такие как раковые стволовые клетки (CSCs) или резистентные к препаратам клоны — обладающие отличными метиломными сигнатурами

Данный технологический прогресс не является просто инкрементальным улучшением; это предпосылка для понимания основных признаков рака, таких как уклонение от контроля роста и резистентность к апоптозу, которые часто управляются этими специфическими субклонами.

Обзор предоставляет всесторонний сравнительный анализ, оценивающий технические и химические возможности новых одноклеточных модальностей для различения профилей метилирования ДНК. Выделяя стратегические рабочие процессы этих развивающихся технологий наряду с передовыми вычислительными инструментами, подчеркивается, как разрешение этих дискретных вариантов цитозина обеспечивает:

• Точное отслеживание клеточных линий
• Идентификацию рефрактерных клонов
• Реализацию локус-специфических эпигенетических редактирующих терапий против каузальных опухолевых субклонов

Технология scDNAme открывает новые возможности для понимания механизмов, лежащих в основе опухолевой прогрессии и лекарственной резистентности на уровне отдельных клеток, что критически важно для разработки персонализированных терапевтических стратегий в онкологии.