Исследование молекулярных фенотипов эмбрионально-анатомических отделов толстой кишки выявило фундаментальные различия между нормальной слизистой и опухолевой тканью. Анализ экспрессионных профилей 408 образцов (254 нормальных и 154 опухолевых) показал, что при колоректальном раке происходит сглаживание естественных молекулярно-фенотипических границ между отделами толстой кишки.
В ретроспективное исследование включены образцы от 228 участников. Группа «Норма» состояла из 254 образцов нормальной слизистой оболочки от 74 здоровых доноров без онкологических заболеваний: 90 образцов из правой ободочной кишки, 116 — из левой ободочной кишки, 48 — из прямой кишки.
Группа «КРР» включала 154 образца аденокарциномы стадии T1–4N0–2M0 от 154 пациентов без предшествующей неоадъювантной терапии: 40 образцов из правой ободочной кишки, 54 — из левой, 60 — из прямой кишки. Относительное количество мРНК 61 гена оценивали методом ПЦР с обратной транскрипцией.
Для нормальной слизистой оболочки построена высокоточная дискриминантная модель с точностью классификации 95,8%. Наиболее значимыми (p < 0,05) для дифференцировки анатомических отделов оказались 19 генов: CCND1, SCUBE2, TERT, BAG1, NDRG, IL1b, IL2Ra, IL7, ESR1, TGFb, IGF1, MMP9, MMP11, PAPPA, СD45, CD69, TLR2, TLR4, LIFR.
Для образцов колоректального рака дискриминантная модель включала 27 генов и обеспечивала точность дифференцировки 75,2%. Статистически значимый вклад (p < 0,05) в классификацию вносили гены COX-2, BIRC5, LIFR, TPA, IL1b, MMP11, MMP7 и P16INK4A.
Анализ показал, что генетические изменения при колоректальном раке сглаживают молекулярно-фенотипические границы эмбрионально-анатомических отделов толстой кишки. Эти изменения специфичны для КРР и формируют особый «патологический» молекулярный фенотип, отличающийся от нормального тканевого паттерна.
Объединение образцов двух групп в соответствии с эмбрионально-анатомическим делением продемонстрировало четкое распределение тканей опухоли и здоровой слизистой в пространстве дискриминантных функций, что подтверждает фундаментальные различия в молекулярных профилях между нормой и патологией.
Полученные данные о молекулярных фенотипах опухолей в зависимости от локализации могут иметь значение для оценки прогноза и выбора программы лечения колоректального рака. Выявленные различия в механизмах канцерогенеза между правосторонней и левосторонней локализацией опухолей открывают перспективы для персонализированного подхода к терапии.