Исследователи интегрировали данные single-cell RNA-sequencing из 36 образцов нормальной и опухолевой ткани желудка (набор данных GSE183904) с данными пространственной транскриптомики Visium (GSE251950). Сигнатуры клеточных состояний оценивали в когорте TCGA-STAD (n=375), также выполнена мультиплексная иммуногистохимия образцов трёх пациентов.

Эпителиальное состояние Epi4_AKR1C3 и стромальное FB3_ACTA2 показали номинальное обогащение в опухолевой ткани, тогда как миелоидное состояние Mac2_SPP1 не продемонстрировало значимого различия в композиции между нормой и опухолью. Более высокие баллы сигнатур всех трёх состояний номинально ассоциировались с более короткой общей выживаемостью (log-rank P=0,044, 0,019 и 0,048 соответственно), однако ни одна из ассоциаций не сохранила статистическую значимость после коррекции на множественное тестирование.

Пространственная деконволюция выявила регионы совместного обогащения этих клеточных популяций. Мультиплексная иммуногистохимия предоставила доказательство концепции, подтвердив пространственную близость популяций, определённых соответствующими маркерами.

Работа идентифицирует кандидатную пространственную конфигурацию эпителий–строма–миелоид, ассоциированную с AKR1C3, при раке желудка. Требуются дальнейшие механистические исследования для валидации её биологического и клинического значения.