Аденоплоскоклеточная карцинома поджелудочной железы (ASQ) представляет собой редкий вариант опухоли с плохо определенными клиническими и молекулярными характеристиками по сравнению с обычной протоковой аденокарциномой поджелудочной железы (PDAC). Новое исследование Johns Hopkins продемонстрировало, что несмотря на общие геномные драйверы с PDAC, ASQ обладает транскрипционно различными особенностями с пространственно организованной опухолевой и иммунной гетерогенностью.

Исследователи ретроспективно оценили клинико-патологические характеристики, паттерны лечения и выживаемость пациентов с ASQ, получавших лечение в Johns Hopkins с 2013 по 2023 год (n=178). Геномные ландшафты ASQ (n=244) сравнивались с PDAC (n=29,021) с использованием базы данных FoundationCore. Хирургически резецированные опухоли ASQ (n=11 от 8 пациентов) анализировались с помощью пространственной транскриптомики Visium с сравнительным набором данных PDAC (n=4).

Клинические исходы

Пациенты с ASQ демонстрировали плохие исходы как при резецированном, так и при распространенном заболевании. Это подчеркивает агрессивную природу данного подтипа рака поджелудочной железы.

Геномный анализ

Анализ FoundationCore выявил:

• Аналогичную частоту мутаций KRAS по сравнению с PDAC
• Более высокую потерю MTAP
• Обогащение низкочастотными иммунными биомаркерами (MSI-high, PD-L1+, TMB ≥10 мутаций/Mb) в ASQ по сравнению с PDAC

Пространственная транскриптомика

Пространственный транскриптомный анализ показал:

• Широко схожие пропорции иммунных клеток между подтипами
• Более высокое содержание регуляторных T-клеток в ASQ в контексте скудного обнаружения в PDAC
• Различия в пространственных паттернах колокализации иммунных популяций между ASQ и PDAC
• В ASQ иммунные инфильтраты располагались ближе всего к плоскоклеточным регионам и дальше всего от железистых регионов

Молекулярные особенности

ASQ продемонстрировал:

• Повышенную экспрессию плоскоклеточных/базальных линий по сравнению с PDAC
• Обогащение внутриопухолевых плоскоклеточных регионов путями эпителиально-мезенхимального перехода, апикальных соединений, воспалительных и стрессовых ответов относительно железистой ниши

Результаты исследования поддерживают необходимость разработки подтип-специфических терапевтических стратегий для ASQ. Несмотря на общие геномные драйверы с PDAC, уникальные транскриптомные особенности и пространственная организация опухолевой и иммунной гетерогенности ASQ могут требовать различных подходов к лечению.