Рак поджелудочной железы характеризуется высокой летальностью, что требует совершенствования методов биобанкирования биопсийного материала для молекулярной диагностики. Исследователи сравнили качество РНК в 36 парах свежезамороженных (FF) и фиксированных формалином, залитых в парафин (FFPE) образцов, полученных при эндосонографической тонкоигольной биопсии (EUS-FNB) солидных поражений поджелудочной железы.

FF-образцы помещали в пробирки с RNAlater, подвергали быстрой заморозке и транспортировали в жидком азоте перед хранением при −80 °C в биобанке. FFPE-образцы обрабатывали и хранили по стандартным институциональным протоколам. Оценивали концентрацию РНК, коэффициенты поглощения A260/A280 и A260/A230, показатели качества РНК (RQN) и классификацию контроля качества (QC) перед анализом, присвоенную лабораторией на основе измерений РНК, электрофореграмм и требований к входному материалу для анализа.

FF-образцы показали значительно более высокие концентрацию РНК, коэффициенты A260/A280 и A260/A230, а также RQN по сравнению с парными FFPE-образцами (все p < 0.001). Ни один образец не достиг статуса «Pass». Все 36 FF-образцов классифицированы как «Hold», тогда как 25 из 36 FFPE-образцов (69.4%) получили статус «Fail» (p < 0.001).

Длительность архивного хранения была значительно больше в группе FFPE «Fail» по сравнению с группой «Hold» (медиана 5.52 против 4.14 месяца; p = 0.006).

FF-протокол обеспечил значительно лучшие показатели качества РНК и меньше отказов при предварительном контроле качества по сравнению с FFPE-протоколом. Помещение образцов в пробирки с предварительно заполненным RNAlater с последующей быстрой заморозкой и хранением при −80 °C может представлять практическую стратегию биобанкирования малых образцов EUS-FNB поджелудочной железы.

Однако предварительный контроль качества не гарантирует успеха последующих анализов, поэтому необходима дальнейшая валидация эффективности профилирования и долгосрочной стабильности.