Комплексное геномное профилирование (CGP) рассматривается как диагностический инструмент для определения первичной локализации опухоли у пациентов с раком неизвестной первичной локализации (CUP). В исследование включены пациенты с CUP, диагностированным с июля 2017 по январь 2022 года. Для определения tissue-of-origin использовали 90-генную экспрессионную панель, CGP выполняли на системе Illumina NextSeq 500. Анализ выживаемости проводили методом Каплана-Мейера, многофакторный анализ — с использованием модели пропорциональных рисков Кокса.

В окончательный анализ включены 48 пациентов. 90-генная панель идентифицировала 11 различных типов опухолей. Наиболее частым оказался рак легкого (n=10, 20,8%). Медиана общей выживаемости составила 19,2 месяца (95% CI 13,6–24,7). CGP выполнено на 36 образцах. Среднее число non-silent мутаций на образец — 8,2 (диапазон 1–30). Наиболее часто мутировавшие гены: TP53, KRAS, KMT2D, BRAF, CIC, SMAD4, KEAP1, SMARCA4 и STK11.

Персонализированная терапия (PCPT), направленная результатами CGP, показала значительное увеличение общей выживаемости по сравнению с эмпирической терапией: медиана ОВ 23,8 vs 9,7 месяцев (HR 0,39; 95% CI 0,24–0,63; p<0,001). Многофакторный анализ выявил независимые прогностические факторы, ассоциированные с увеличением ОВ: PCPT как начальная терапия (HR=0,21, p=0,02), женский пол (HR=0,33, p=0,02) и благоприятный функциональный статус (HR=0,32, p<0,001).

Комплексное геномное профилирование способствует определению первичной локализации при CUP и обеспечивает персонализированный подход к терапии. Данные поддерживают значимую ассоциацию между PCPT и увеличением общей выживаемости по сравнению с эмпирической химиотерапией. Эта стратегия лечения заслуживает дальнейших исследований.