Исследователи проанализировали транскриптомные и клинические данные 620 пациентов из TCGA-COAD и TCGA-READ, проведя скрининг длинных некодирующих РНК, коррелирующих с TRPM4. С использованием Cox- и LASSO-регрессии разработана пятикомпонентная прогностическая модель, включающая AC074212.1, ALMS1-IT1, RBM26-AS1, AC009133.1 и AC147067.1. Пациенты группы высокого риска демонстрировали худшую общую выживаемость как в обучающей, так и во внутренней валидационной когортах. Площадь под ROC-кривой (AU-ROC) составила 0.689, 0.667 и 0.623 на 1-, 3- и 5-летних точках соответственно.

Экспрессия ALMS1-IT1 была повышена в клеточных линиях SW480 и RKO по сравнению с нормальными клетками NCM460. Подавление ALMS1-IT1 приводило к снижению включения EdU и колониеобразования, замедлению закрытия раны, уменьшению миграции и инвазии в Transwell-анализе. Эти изменения сопровождались снижением уровней транскриптов PLA2G4A и PTGS2 и уменьшением содержания белков cPLA2 и PTGS2.

В модели подкожных ксенотрансплантатов с использованием siRNA-трансфицированных клеток SW480 опухоли в группе si-ALMS1-IT1 на конечной точке (2 недели) весили меньше, чем контрольные опухоли. Данные подтверждают функциональную значимость ALMS1-IT1 в прогрессии колоректального рака и указывают на регуляцию пути cPLA2/PTGS2 как потенциальный механизм. Авторы подчеркивают необходимость внешней валидации прогностической модели и дальнейшего изучения механизмов, лежащих в основе наблюдаемых эффектов.