PANоптоз представляет собой новый тип программируемой клеточной смерти, который может играть важную роль в развитии злокачественных новообразований. Данное исследование было проведено для скрининга биомаркерных генов, связанных с PANоптозом, и изучения основных механизмов их действия при светлоклеточном почечноклеточном раке (ccRCC).
Исследователи идентифицировали дифференциально экспрессированные гены, связанные с PANоптозом, и использовали их для построения прогностической модели. Анализ scRNA-seq показал, что показатели PANоптоза значительно различались между 9 типами клеток в опухолевом микроокружении.
Всего было идентифицировано 26 дифференциально экспрессированных генов, связанных с PANоптозом, путем пересечения дифференциально экспрессированных генов и генов, связанных с PANоптозом. Затем были отобраны 3 прогностических биомаркерных гена для построения прогностической модели: TLR3, GSN и TNFRSF1A.
Показатель риска был ассоциирован со степенью опухоли, стадией (I, II, III, IV), патологической T-стадией и также значительно коррелировал с иммунными клетками и экспрессией белков иммунных контрольных точек.
GSN был повышенно экспрессирован при ccRCC, и высокая экспрессия GSN указывала на благоприятную общую выживаемость. Эксперименты in vivo и in vitro показали, что жидко-жидкостное фазовое разделение (LLPS) GSN непосредственно индуцирует PANоптоз при ccRCC путем ингибирования YAP-зависимого гликолиза.
Установленная прогностическая модель, основанная на PANоптозе с использованием TLR3, GSN и TNFRSF1A, продемонстрировала хорошую прогностическую способность для предсказания прогноза пациентов с ccRCC. LLPS GSN непосредственно индуцирует PANоптоз при ccRCC путем ингибирования YAP-зависимого гликолиза, что открывает новые терапевтические возможности.