Глиобластома CNS WHO Grade 4 (GBM) характеризуется неблагоприятным прогнозом и высокой частотой рецидивов, несмотря на существующие терапевтические подходы. Стандартная визуализация, прежде всего МРТ, используется для детекции рецидива опухоли, но имеет ограниченную способность отличить истинный рецидив от терапевтических изменений — таких как некроз тканей и послеоперационная рубцовая ткань.

Жидкостная биопсия с использованием циркулирующих опухоль-специфичных серологических биомаркеров, таких как miRNA, предоставляет профиль экспрессии генов для раннего выявления рецидива GBM. Это пилотное «proof-of-concept» исследование изучало потенциал циркулирующих опухоль-ассоциированных miRNA в образцах цельной крови для ранней детекции рецидива опухоли.

В предшествующем скрининговом исследовании полного транскриптома (NGS) использовались образцы цельной крови (n=33) от семи пациентов и биопсии опухолей (n=4) для идентификации биомаркеров. Экспрессия miRNA изучалась в предоперационных образцах крови и тканях опухоли в соответствии с хирургией опухоли и рецидивом.

Исследователи искали паттерн в цельной крови, указывающий на снижение уровня miRNA после операции (соответствующее уменьшению опухолевой нагрузки), с последующим возвратом к предоперационным уровням при рецидиве. Было идентифицировано 1–19 видов miRNA на пациента (всего 72 miRNA), демонстрирующих этот паттерн.

Для валидации методом qRT-PCR были отобраны 45 наиболее перспективных miRNA, выявленных в NGS-исследовании. Дополнительно включена miR-21 как перспективный кандидат, описанный в литературе. Для решения проблем нормализации miRNA сравнивались пять стратегий нормализации и ненормализованные сырые значения Ct.

Два подхода нормализации (медианная ΔCt нормализация и ненормализованные сырые значения Ct) не показали систематического смещения. В зависимости от метода нормализации, согласованность между NGS и qRT-PCR составила от 23,6 до 27,9%.

Хотя конкордантность между NGS и qRT-PCR была низкой на уровне отдельных пациентов, qRT-PCR идентифицировала общий набор из 24 miRNA, дифференциально регулируемых у пациентов. Примечательно:

• miR-424-3p и miR-362-5p были общими для пяти из семи пациентов
• miR-1307-3p и miR-22-5p — у четырёх пациентов каждая
• miR-21 не показала предопределённого рецидив-ассоциированного паттерна ни у одного пациента, несмотря на литературные данные

Профилирование miRNA на основе крови может дополнить визуализацию при продольном мониторинге пациентов с GBM, хотя клиническая польза пока не подтверждена. Авторы подчёркивают необходимость валидации на более крупной независимой когорте перед внедрением в клиническую практику.

Исследование демонстрирует принципиальную возможность использования циркулирующих miRNA для детекции рецидива глиобластомы, но выявляет технические трудности воспроизводимости результатов между NGS и qRT-PCR платформами и необходимость стандартизации методов нормализации.