Исследователи провели комплексный анализ 49 опухолей от 19 пациентов с колоректальным раком, включая первичные опухоли и парные метастазы в печень (CLiM) и легкие (CLuM). Филогенетическая реконструкция показала, что микрометастазы в печени (CLiMi) возникали из ранних клональных дивергенций и характеризовались стволово-клеточным состоянием покоя, согласующимся с метастатической дормантностью.
Для комплексного профилирования использовались:
- Пространственная транскриптомика с высоким разрешением на уровне отдельных участков
- Мультирегиональное полногеномное секвенирование после лазерной микродиссекции
- Мультиплексная протеиновая визуализация высокого разрешения
Исследование охватило все основные паттерны метастазирования колоректального рака с детальным анализом пространственной архитектуры опухолевого микроокружения.
Выявлены различные стромальные барьеры: макрометастазы были окружены миофибробластами, тогда как микрометастазы располагались в иммуносупрессивных нишах, характеризующихся истощением T-клеток и специфическими сетями лиганд-рецепторного взаимодействия.
Идентифицирована CLiMi-специфическая сигнатура из шести генов, ассоциированная с:
- Статусом минимальной остаточной болезни (MRD)
- Безрецидивной выживаемостью
- Резистентностью к химиотерапии
Сигнатура валидирована на нескольких независимых когортах, что подтверждает ее потенциал для клинического применения в качестве биомаркера для мониторинга и таргетной терапии.