В когортах TCGA экспрессия CMTM3 (CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing 3) ассоциировалась с более высокой степенью ВОЗ, IDH-диким типом и старшим возрастом пациентов с глиомами. В группе TCGA-GBM более высокая экспрессия CMTM3 коррелировала с более коротким общим выживанием. Анализ данных секвенирования единичных клеток показал экспрессию CMTM3 в нескольких популяциях глиобластомы с преобладанием в эндотелиальных и муральных/периваскулярных кластерах.
Подавление экспрессии CMTM3 в клеточных линиях U87 и U251 привело к нарушению миграции, снижению клоногенной способности и уменьшению метаболической активности клеток. Анализ GO/KEGG выявил обогащение процессов, связанных с процессингом белков в эндоплазматическом ретикулуме.
При индукции стресса ЭПР туникамицином (2 мкг/мл, 24 ч) клетки с подавленным CMTM3 демонстрировали более низкие уровни белков p-PERK, ATF4 и XBP1s по сравнению с контрольными клетками, тогда как уровни BiP и CHOP существенно не различались. Однако двухфакторный ANOVA не выявил значимого взаимодействия между нокдауном CMTM3 и воздействием туникамицина ни для одного из пяти исследованных белков.
Результаты расширяют представления о роли CMTM3 в глиобластоме, выявляя ассоциации с отдельными UPR-связанными белками при воздействии туникамицина и с сосудисто-стромальными характеристиками микроокружения опухоли. Данные создают основу для дальнейшего изучения клеточного контекста и стресс-ответных механизмов с участием CMTM3 при глиобластоме.