Последнее десятилетие ознаменовалось разработкой эпигенетических моделей старения, которые точно оценивают хронологический возраст и прогнозируют заболеваемость и смертность. Эти оценки модулируются факторами образа жизни и окружающей среды, связанными с канцерогенезом, однако до настоящего времени это изучалось преимущественно в крови.
Исследователи проанализировали эпигенетическое старение в нормальной ткани толстой кишки (n = 96), прилежащей слизистой оболочке (n = 245) и опухолях (n = 208), используя модели, обученные на возрасте (Horvath, Hannum, Zhang), смертности (PhenoAge, GrimAge), скорости старения (DunedinPACE), клеточной митотической истории (EpiTOC, epiTOC2, miAGe) и длине теломер (DNAmTL).
Модель Horvath оказалась наиболее точным предиктором хронологического возраста в нормальной слизистой оболочке толстой кишки, с высокой корреляцией (r > 0.70) между моделями Horvath, Hannum, Zhang, PhenoAge и GrimAge, а также между митотическими часами (r > 0.94).
Все модели показали сходную эффективность в нормальной ткани и прилежащей слизистой оболочке, но существенно большую вариабельность в оценках опухолей. Значительные различия в ускорении старения присутствовали между нормальной и прилежащей слизистой оболочкой по шести моделям (Hannum, Zhang, PhenoAge, EpiTOC, epiTOC2 и miAge), в то время как опухоли показали высоко значимые различия по всем моделям.
Ускорение старения различалось по регионам толстой кишки с различными паттернами в зависимости от типа модели. Физическая активность (PhenoAge), курение в анамнезе (GrimAge) и потребление алкоголя (Horvath, митотические часы) были ассоциированы с эпигенетическим старением в прилежащей слизистой оболочке, в то время как курение в анамнезе, интенсивность курения и потребление алкоголя были связаны с DNAmTL в опухолях.
Исследование выявляет влияние типа ткани, региона и факторов образа жизни на эпигенетическое старение, но также подчеркивает значительную гетерогенность между моделями и необходимость тщательного рассмотрения в дизайне исследований. Эти данные расширяют понимание роли эпигенетических изменений в процессе канцерогенеза колоректального рака.