Соматические мутации часто предсказывают выживаемость при детских злокачественных новообразованиях, как показано на примере рабдомиосаркомы (РМС), где статус слияния гена FOXO1 является ключевым прогностическим признаком. В данном исследовании анализ одноклеточных транскриптомов выявил, что опухолевые клетки летальных форм заболевания конвергируют к общему клеточному состоянию с единым транскрипционным ландшафтом, независимо от статуса слияния.
Главные находки были подтверждены с использованием комплексного подхода, включающего:
- Ядерную транскриптомику
- Анализ доступности хроматина
- Пространственную транскриптомику
- Пертурбационные исследования
- Ранее опубликованные датасеты
Конвергентное клеточное состояние лишь частично перекрывалось с транскрипционными эффектами слияния FOXO1 и неожиданно демонстрировало нейральные характеристики.
Выявленное клеточное состояние РМС высокого риска трансцендирует традиционные молекулярные и гистологические границы, предполагая существование всеобъемлющего фенотипа заболевания. Это открытие может трансформировать поиск терапевтических мишеней и повлиять на клиническую практику.
Определение конвергентного клеточного состояния рабдомиосаркомы высокого риска, которое выходит за рамки существующих гистологических и молекулярных признаков, предиктивных исхода, предоставляет биологические инсайты в агрессивное течение заболевания и открывает потенциальные биомаркеры и терапевтические мишени.