Светлоклеточный почечно-клеточный рак (ccRCC) — наиболее частая форма опухолей почки с высокой частотой рецидивов и прогрессирования. Раннее выявление ccRCC могло бы значительно улучшить выживаемость. Жидкостные биопсии способны отражать молекулярную информацию, проливающую свет не только на сигнатуры возникновения ccRCC, но и на потенциальные биомаркеры для ранней диагностики.
Исследователи применили жидкостную хроматографию — масс-спектрометрию (LC-MS) для профилирования протеома и метаболома мочи у 314 пациентов с ccRCC, 341 здорового контроля и 49 пациентов с доброкачественными заболеваниями почек, набранных из трёх когорт. Дополнительно выполнена аннотация клеточного происхождения белков и анализ белок-белковых корреляций для объяснения возможных механизмов микроокружения опухоли (TME).
Выявлены значимые изменения организации внеклеточного матрикса (ECM), каскадов комплемента и коагуляции, метаболизма аминокислот и жирных кислот при ccRCC. Аннотация клеточного происхождения раковых белков указала на потенциальную роль миофибробластов в организации внеклеточного матрикса.
Обнаружены шесть потенциальных биомаркеров мочи: FGB, CILP, ITIH1, GUCA2B, ансерин и оксиндол. Установлены модели для диагностики ccRCC:
- Протеомная модель: AUC = 0.84
- Метаболомная модель: AUC = 0.80
- Мультиомиксная модель: AUC = 0.86 во внешней когорте
Протеомная модель также продемонстрировала способность разделять ccRCC и доброкачественные заболевания почек с AUC = 0.75.
Настоящее исследование выявило молекулярные изменения в моче, которые могут отражать нарушения микроокружения опухоли и перепрограммирование клеточного метаболизма при светлоклеточном раке почки. Установленная панель биомаркеров демонстрирует потенциал для неинвазивной ранней диагностики ccRCC.