Интегрированный анализ протеома и фосфопротеома выявил ось IKBKB–CARD11–NF-κB–PD-L1, связанную с иммунным ускользанием и неблагоприятным прогнозом у PD-L1-позитивных пациентов с ДВКЛ.

Высокоплексная сывороточная протеомика идентифицировала стадийно-зависимые белковые сигнатуры при грибовидном микозе (пятно → бляшка → опухоль), с константным снижением ADAM22 и LRRN1 при прогрессии. В стадии бляшки профили разделили прогрессирующее и индолентное течение; top-биомаркеры — interleukin-32 и PARP1. Панель из 11 белков достигла AUC 0,952 для неинвазивной стратификации риска.

Масс-спектрометрическая протеомика с пространственным разрешением может помочь в дифференциальной диагностике ранней меланомы и пограничных меланоцитарных поражений, но требует проспективной валидации.

Анализ 1801 белка плазмы у 851 пациента с колоректальным раком за 7 лет до диагноза выявил различия протеомных профилей между раком толстой и прямой кишки (P=0.005). Для рака толстой кишки характерно снижение уровней белков (11 из 12, включая BCAN), для прямой — повышение (25 из 28, включая HDGF).

Протеомный и метаболомный анализ парных образцов плазмы у пациентов с распространённым раком молочной железы показал масштабную молекулярную перестройку на фоне T-DXd: 508 дифференциально экспрессированных белков и 70 метаболитов, а также шесть белковых и четыре метаболитных кандидата в прогностические биомаркеры выживаемости без прогрессирования.

Исследование уринарных протеомов 329 пациентов с локализованным раком предстательной железы выявило значительные различия между пациентами африканского и европейского происхождения, что подчеркивает важность учета этнических факторов при разработке биомаркеров.

Исследование проспективно валидировало 19-биомаркерную модель на основе анализа мочи методом капиллярного электрофореза с масс-спектрометрией для диагностики клинически значимого рака простаты. Тест показал AUC 0.79, превосходя PSA, ERSPC и mpMRI, что может снизить потребность в инвазивных процедурах.

Многоомиксное исследование мочи 314 пациентов со светлоклеточным раком почки выявило значимые изменения организации внеклеточного матрикса, каскадов комплемента и коагуляции, метаболизма аминокислот и жирных кислот. Установлена панель из шести биомаркеров (FGB, CILP, ITIH1, GUCA2B, ансерин, оксиндол) с AUC 0.86 для диагностики ccRCC во внешней когорте.

Многомодальное исследование 95 образцов фолликулярной лимфомы и трансформированной ФЛ выявило ключевые изменения в микроокружении опухоли: увеличение количества фибробластов и GPNMB+ макрофагов при потере фолликулярных дендритных клеток и CCL21+ фибробластических ретикулярных клеток.