Определение клинически значимых мутаций в жидких биопсиях является критически важным инструментом персонализированной онкологии при немелкоклеточном раке легкого (НМРЛ). Бразильские исследователи оценили возможности мультигенной панели для анализа циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA) у 30 пациентов с НМРЛ.

Наиболее часто мутировавшие гены: TP53 (40,6%), KRAS (28,1%) и EGFR (12,5%), особенно у пациентов, ранее получавших лечение. Мутации BRAF, MAP2K1, PIK3CA и ALK встречались с частотой 6,2%, 3,1%, 3,1% и 3,1% соответственно. Вариантов в генах NRAS, ROS1 и MET не обнаружено.

Проанализировано 32 образца от 30 пациентов с НМРЛ, включая четыре образца из программы скрининга рака легкого. Выделение ctDNA и подготовка библиотек выполнялись с использованием Oncomine Lung cfDNA Assay, охватывающей 11 клинически значимых генов, с последующим секвенированием на Ion S5 Sequencer.

Медиана покрытия достигла 80 967 прочтений, предел обнаружения составил 0,1%. Для определения вариантов использовалось программное обеспечение IonReporter 5.20.

Мутация EGFR p.T790M, связанная с резистентностью к терапии, была идентифицирована у ранее леченного пациента. Мутация TP53 p.R248Q была обнаружена у бессимптомного пациента до установления диагноза, демонстрируя потенциал панели для раннего выявления заболевания.

Данная коммерческая NGS-панель способна выявлять клинически значимые мутации, обеспечивая возможности для раннего обнаружения НМРЛ, мониторинга лечения и наблюдения за заболеванием. Метод показал высокую чувствительность (предел обнаружения 0,1%) и глубину покрытия, что делает его применимым как в клинической практике, так и в скрининговых программах.