Trastuzumab deruxtecan (T-DXd) продемонстрировал клиническую активность при HER2-позитивном и HER2-низком распространённом раке молочной железы, но исходы лечения остаются гетерогенными, а циркулирующие молекулярные корреляты ответа и прогноза изучены недостаточно. Исследователи провели многоплатформенное профилирование плазмы до и после двух циклов терапии, чтобы идентифицировать молекулярные изменения, ассоциированные с лечением, и потенциальные прогностические биомаркеры.

В когорту включены пациенты, получающие T-DXd, из которых 16 предоставили парные образцы плазмы (до лечения и после второго цикла) для мультиомиксного профилирования. Протеомика выполнена методом 4D-DIA LC-MS/MS, метаболомика — UHPLC-высокоразрешающей масс-спектрометрией в положительном и отрицательном режимах.

Ассоциированные с лечением признаки идентифицировали парной статистикой, кратностью изменения и многофакторными критериями, затем проводили анализ обогащения, корреляционный и совместный анализ путей, а также поисковый Cox/LASSO-Cox анализ, ориентированный на выживаемость без прогрессирования (PFS).

Протеомный анализ выявил 4444 белка, из которых 508 дифференциально экспрессированы (136 увеличены, 372 снижены). Эти белки обогащены в путях трансляции/рибосомы, комплемента/коагуляции, острой фазы, цитоскелета/адгезии и транспорта липидов.

Метаболомика детектировала 3596 признаков, 70 дифференциально представлены (43 повышены, 27 снижены), обогащены в метаболизме аминокислот, триптофана, нуклеотидов/энергии и липидов.

Кросс-омиксный анализ выявил структурированные корреляции и совместное картирование на уровне пуринового метаболизма.

Поисковый анализ исходных уровней отобрал шесть белковых и четыре метаболитных прогностических биомаркера для визуализации PFS. Эти кандидаты требуют валидации в крупных независимых когортах.

Парный плазменный мультиомиксный анализ выявил протеомную и метаболическую перестройку, ассоциированную с T-DXd. Молекулярные паттерны и биомаркеры, связанные с PFS, носят гипотезогенерирующий характер и требуют валидации в более крупных независимых когортах.