Соматическое тестирование опухолей всё чаще выявляет патогенные варианты (PV), определяющие тактику противоопухолевого лечения. Согласно рекомендациям ESMO 2019 года, многие соматические PV в генах предрасположенности к раку требуют подтверждающего герминального генетического тестирования (gGT). Приблизительно у 4–40% пациентов обнаруживаются соматические PV, соответствующие критериям для gGT. Выявление герминальных PV имеет значимые клинические последствия: персонализированный скрининг, профилактические вмешательства и каскадное тестирование родственников из группы риска.

PV в генах предрасположенности к раку обнаруживаются примерно у 5–10% пациентов с раком молочной железы, 13–25% — с раком яичников, 6% — с метастатическим раком предстательной железы и 4–7% — с раком поджелудочной железы. Однако соответствие (конкордантность) между соматическими и герминальными PV охарактеризовано недостаточно.

Проведено ретроспективное когортное исследование пациентов с BRCA-ассоциированными опухолями, которым выполнено соматическое тестирование опухоли в период 2020–2023 гг. в Columbia University Irving Medical Center (Нью-Йорк). Описательная статистика использована для определения частоты выявления соматических PV в генах предрасположенности к раку и их конкордантности с результатами gGT.

Среди 1033 пациентов средний возраст составил 66,5 лет (SD 12,3); 61,5% — женщины. Когорта включала 50% белых, 18% латиноамериканцев, 13% афроамериканцев, 11% азиатов/других, 7% — раса неизвестна.

Соматический PV в генах предрасположенности к раку выявлен у 145 пациентов (14,0%), наиболее часто в BRCA2 (3,3%) и BRCA1 (1,9%). Из них 120 (83%) прошли подтверждающее gGT, которое выявило герминальный PV у 29 пациентов (общая конкордантность 24,2%).

Наивысшие показатели конкордантности зафиксированы для BRCA1 (45%), BRCA2 (30%) и PALB2 (30%). Один герминальный PV обнаружен в MSH2 (14,3%), но не в других генах синдрома Линча.

| Ген | Соматический PV, N (%) | Прошли gGT, N (%) | Конкордантность, N (%) | |-----|------------------------|-------------------|------------------------| | BRCA2 | 34 (3,3) | 30 (88,2) | 9 (30,0) | | BRCA1 | 20 (1,9) | 20 (100,0) | 9 (45,0) | | POLE | 15 (1,5) | 8 (53,3) | 1 (12,5) | | PALB2 | 10 (1,0) | 10 (100,0) | 3 (30,0) | | BRIP1 | 9 (0,9) | 6 (66,7) | 1 (16,7) | | PMS2 | 8 (0,8) | 6 (75,0) | 0 | | MSH2 | 7 (0,7) | 7 (100,0) | 1 (14,3) | | Другие* | 42 (4,0) | 33 (78,6) | 5 (15,2) | | Всего | 145 (14,0) | 120 (82,8) | 29 (24,2) |

*Включая SDHA, , , , , , , , , .