Исследователи из Турина провели одно из крупнейших популяционных исследований случай-контроль, изучив кишечную микробиоту в остаточных образцах фекального иммунохимического теста (ФИТ) из программы скрининга колоректального рака. Работа демонстрирует потенциал использования материала скрининговых программ для проспективного изучения роли микробиома в канцерогенезе.
Ключевые находки:
- Альфа-разнообразие микробиоты обратно связано с колоректальными неоплазиями
- Оральные патогены, включая Parvimonas micra, ассоциированы с повышенным риском колоректального рака
- Escherichia coli и Bacteroides fragilis связаны с более высокими шансами всех типов колоректальных неоплазий
Исследование включало 925 участников программы скрининга колоректального рака в Турине:
- 44 пациента с колоректальным раком
- 269 пациентов с продвинутыми аденомами
- 134 пациента с ранними аденомами
- 478 ФИТ-негативных контролей
Из остаточного материала ФИТ извлекали ДНК и проводили полногеномное секвенирование. Оценивались альфа- и бета-разнообразие, относительная представленность видов, генов и метаболических путей с использованием многофакторных логистических регрессионных моделей.
Альфа-разнообразие
Альфа-разнообразие показало обратную ассоциацию с колоректальными неоплазиями, наиболее выраженную для ранних аденом (OR: 0.45, 95% CI: 0.25-0.80; P = 0.01). Это указывает на то, что снижение микробного разнообразия может быть ранним маркером неопластических изменений.
Специфические микроорганизмы
Оральные патогены демонстрировали особую значимость:
- Parvimonas micra ассоциирована с повышенными шансами колоректального рака
- Присутствие оральной микрофлоры в кишечнике может отражать нарушение барьерной функции
Условно-патогенные бактерии показали устойчивые ассоциации:
- Escherichia coli связана с повышенными шансами всех типов колоректальных неоплазий
- Bacteroides fragilis демонстрировала аналогичные ассоциации
Функциональный анализ
Несколько генов и метаболических путей показали значимые ассоциации с колоректальными неоплазиями, что указывает на функциональные изменения микробиома, сопровождающие неопластический процесс.
Исследование подтверждает результаты более мелких исследований микробиома и колоректальных неоплазий, демонстрируя воспроизводимость ключевых находок в крупной популяционной выборке.
Практические аспекты: