Несмотря на то, что комбинация ниволумаба с ipилимумабом является стандартной первой линией терапии нерезектабельной злокачественной плевральной мезотелиомы (ЗПМ), биомаркеры, предсказывающие эффективность ингибиторов контрольных точек (ИКТ), остаются неопределенными. Исследователи проанализировали два независимых когорты пациентов с ЗПМ для выявления геномных и микроокружающих опухоль иммунологических особенностей, ассоциированных с ответом на ИКТ.
Когорта открытия включала пациентов Национального онкологического центра (2012–2022) с доступными замороженными образцами опухоли для полногеномного секвенирования (WGS) и RNA-секвенирования. Анализировались геномные альтерации, транскриптомные профили, клеточный состав иммунного инфильтрата и репертуар T-клеточных рецепторов. Ключевые находки валидировались в общенациональной когорте Center for Cancer Genomics and Advanced Therapeutics (C-CAT).
WGS-когорта включила 52 пациента. Среди пациентов, получавших ИКТ, общая частота ответа составила 30% в WGS-когорте и 29,4% в C-CAT-когорте. Геномный анализ выявил частые альтерации в генах BAP1 и NF2 в обеих когортах.
Пациенты, ответившие на ИКТ, демонстрировали более высокое разнообразие T-клеточных рецепторов, повышенную инфильтрацию CD8⁺ T-клетками и обогащение макрофагами типа M1 по сравнению с неответчиками. Потеря MTAP была ассоциирована с более высокой инфильтрацией CD8⁺ T-клетками и разнообразием T-клеточного репертуара, а также связана с более высокой частотой ответа на ИКТ в C-CAT-когорте. Напротив, альтерации BAP1 и NF2 не показали последовательной ассоциации с иммунными характеристиками или эффективностью ИКТ.
Иммуноактивное опухолевое микроокружение, характеризующееся высоким разнообразием T-клеточных рецепторов, инфильтрацией CD8⁺ T-клетками и обогащением макрофагами M1, ассоциировано с благоприятным ответом на ИКТ при ЗПМ. Потеря MTAP связана с иммунологическими особенностями и более высокой частотой ответа на ИКТ, что обосновывает дальнейшее изучение потери MTAP как кандидатного биомаркера.