Химерные онкопротеины NUP98 формируют биомолекулярные конденсаты через фазовое разделение, взаимодействуя с гистоновыми ацетилтрансферазами MYST-семейства. Ингибирование KAT6A/7 и CBP/p300 продемонстрировало эффективность в доклинических моделях NUP98-реаранжированного ОМЛ, включая синергизм с менин-ингибитором SNDX-5613.

CRISPR-скрининг и библиотеки транскрипционных факторов идентифицировали TAB1 (TAK1-binding protein 1) как ключевой узел поддержания мезенхимального состояния клеток нейробластомы. Нокаут TAB1 приводил к потере MES-генной экспрессии и повышению химиочувствительности к нескольким классам препаратов.

Разработана иммунокомпетентная модель синовиальной саркомы с экспрессией SS18-SSX2, делецией Pten и активацией β-catenin, демонстрирующая 100% пенетрантность и развитие опухолей в течение 3 недель. Модель характеризуется выраженным опухолевым микроокружением и чувствительностью к химиотерапии.

Анализ DepMap показал, что ISWI-программа, репрессированная при двойном нокауте SMARCA1/SMARCA5, достоверно выше в саркомах с транслокациями и педиатрических/AYA-моделях (p=6.6e-6 и p=4.11e-5). Рабдомиосаркома демонстрирует наиболее выраженную ISWI-зависимость, что указывает на потенциальную терапевтическую уязвимость через хроматин-ремоделирующие комплексы.

CRISPR-скрининг выявил дефицит ДНК-лигазы 1 (LIG1) как биомаркер чувствительности к ингибиторам NAMPT в педиатрических саркомах. LIG1-knockdown повышает чувствительность к FK866 в 6–8 раз за счет гиперактивации PARP и истощения NAD+, что открывает путь к рациональным комбинациям.

Таргетное секвенирование cfDNA из водянистой влаги глаза (LBSeq4Kids) позволило выявить оба инактивирующих события RB1 у 81,5% пациентов с ретинобластомой, устраняя необходимость в противопоказанной биопсии опухоли и обеспечивая точную молекулярную диагностику в живых глазах.

Разработан вычислительный конвейер для создания патентоспособных пролекарственных модификаций генерических препаратов, решающий проблему интеллектуальной собственности при репозиционировании препаратов для педиатрических опухолей. Система генерирует 300-500 новых кандидатов на препарат с автоматической оценкой ADMET-профиля и проникновения через ГЭБ.

Нокаут B7-H3 в сингенной модели медуллобластомы значимо увеличивает выживаемость (p<0.0001), повышает инфильтрацию CD8+ Т-клеток и снижает экспрессию иммуносупрессивных маркеров (Arg1, CD206) в опухоль-ассоциированных макрофагах, что открывает перспективы для комбинации ингибиторов B7-H3 с блокадой PD-1 при рецидивирующих педиатрических опухолях мозга.

Одноклеточное профилирование 17 опухолей остеосаркомы человека выявило четыре регуляторных состояния с различными уязвимостями, которые динамически перестраиваются под действием химиотерапии. Анализ >600 000 клеток в PDX-моделях после MAP-терапии показал обогащение хондрогенными популяциями, устойчивыми к лечению, и позволил предсказать комбинации для преодоления резистентности.

Исследование показывает, что потеря функции NF1 при нейробластоме специфически снижает экспрессию SMARCA2 независимо от канонического пути RAS–MEK–ERK, нарушает архитектуру хроматина и создает уязвимость к комбинации PARP-ингибиторов с MEK-ингибиторами, открывая новую терапевтическую стратегию для NF1-мутантной нейробластомы высокого риска.