Исследование с использованием пространственной транскриптомики, секвенирования всего генома и мультиплексной протеиновой визуализации выявило особенности микрометастазов колоректального рака в печени, включая состояние покоя и иммуносупрессивные ниши, что объясняет механизмы минимальной остаточной болезни.

Исследование показало, что культивирование органоидов протоковой аденокарциномы поджелудочной железы в гипоксических условиях (1% O₂) лучше сохраняет базально-подобные субпопуляции опухолевых клеток по сравнению с нормоксическими условиями, что более точно отражает внутриопухолевую гетерогенность первичных новообразований.

Новое исследование создает пространственную карту мышечно-инвазивного рака мочевого пузыря, показывая, как различные клеточные линии опухоли организованы в пространстве и связаны с особенностями иммунного микроокружения и чувствительности к терапии.

Разработан мультимодальный фреймворк CarHE, который использует контрастное обучение для предсказания пространственных транскриптомных профилей по H&E-окрашенным срезам. В когорте из 880 пациентов с раком легкого CarHE-производные признаки ассоциировались с безрецидивной выживаемостью и превосходили существующие подходы.

Исследование характеристик редкого варианта рака поджелудочной железы — аденоплоскоклеточной карциномы (ASQ) — выявило уникальные геномные и транскриптомные особенности, отличающие его от обычной протоковой аденокарциномы поджелудочной железы.

Исследование с использованием пространственной транскриптомики выявило молекулярные различия между десмопластическим и замещающим паттернами роста печеночных метастазов колоректального рака, что может открыть новые терапевтические подходы.