Новый метод TRECS интегрирует эпигеномные и транскриптомные данные для динамической маркировки клеточных состояний нейробластомы в режиме реального времени. Исследование выявило хеморезистентное мезенхимоподобное состояние, контролируемое FOSL1, и продемонстрировало, что ингибирование гистоновых ацетилтрансфераз EP300 и CBP повышает чувствительность к химиотерапии.

Синдром Ли-Фраумени как модель наследственного рака: более 85% пациентов несут герминальные мутации TP53. Мультиомные алгоритмы и жидкостная биопсия открывают путь к персонализированному скринингу и ранней интервенции у детей с канцер-предрасполагающими синдромами.

Разработана система MAD Leukemia AI — платформа на основе глубокого обучения для поддержки ранней стратификации риска и клинических решений при педиатрическом ОЛЛ. Предварительная техническая валидация подтвердила выполнимость автоматизированного анализа данных с выделением признаков и классификацией риска; продолжается проспективная клиническая валидация для оценки диагностической точности и воспроизводимости.

Многоцентровое ретроспективное исследование из Квебека показало ORR 27% и DCR 62% при применении ингибиторов контрольных точек у детей, подростков и молодых взрослых с солидными опухолями, отобранными на основе биомаркеров. Медиана PFS составила 32,1 месяца в группе отбора по гистологии/молекулярным маркерам против 7,9 месяца при лечении по другим показаниям.

Исследование механизмов PAX3::FOXO1-опосредованной трансформации показало, что онкослияние критично для инициации альвеолярной рабдомиосаркомы, но не для поддержания опухолевого фенотипа. Модель на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека выявила раннюю активацию миогенных и нейрональных транскрипционных факторов в течение двух дней после экспрессии P3F.

Новый вычислительный подход для глиобластомы объединяет одноклеточное секвенирование РНК >150 000 опухолевых клеток, RNA velocity и структурное моделирование для выявления друггируемых мишеней, существующих только транзиторно — во время перехода к резистентности, до формирования стабильных генетических механизмов устойчивости.

Разработана платформа TAPESTRY для визуализации и анализа данных альтернативного сплайсинга в 1916 педиатрических опухолях ЦНС, позволяющая непрограммирующим исследователям идентифицировать опухоль-специфические изоформы как потенциальные мишени для иммунотерапии.

Исследование молекулярных механизмов инвазии нуклеосом химерным онкопротеином EWSR1::FLI1 при саркоме Юинга выявило, что LCD-домен EWSR1 модулирует распознавание последовательностей ДНК и взаимодействие с нуклеосомами. In vitro эксперименты показали значительные различия в связывании между полноразмерным белком и усеченными конструкциями.

CRISPR-скрининг выявил, что ингибирование менина синергирует с химиотерапией при нейробластоме, подавляя формирование лекарственно-толерантных персистирующих клеток. Ziftomenib показал более сильный синергизм с иринотеканом, чем revumenib, особенно против циклирующих персистеров на 10-й день лечения.

Описан редкий случай агрессивного метастатического FH-дефицитного почечно-клеточного рака у 16-летнего пациента с синдромом предрасположенности к опухолям, вызванным мутацией FH p.H235D. Заболевание оказалось резистентным к множественным линиям терапии, включая Bevacizumab/Erlotinib, ингибиторы контрольных точек, Belzutifan и Cabozantinib. Каскадное генетическое тестирование выявило ту же патогенную мутацию у матери и сестры пациента, которые остаются здоровыми.

In vivo исследование на трех педиатрических PDX-моделях высокозлокачественных глиом продемонстрировало задержку роста опухоли при применении CTO (T/C 31,5–49,5%), тогда как темозоломид не проявил противоопухолевой активности ни в одной из моделей.

Исследователи разработали Nextflow-инструмент metafactory для data-driven идентификации метапрограмм экспрессии генов в данных scRNA-seq. Метод применён к Single-cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) — ресурсу, содержащему >700 образцов >50 типов детских опухолей, и позволяет автоматически выбирать оптимальное число кластеров на основе неизбыточности, разнообразия образцов и биологической интерпретируемости программ.

Комбинация доцетаксела с сенолитиками (ингибиторами BCL2 и IAP) элиминирует сенесцентные опухолевые клетки, перепрограммирует миелоидные популяции и активирует CD8+ T-клетки, значительно подавляя метастатическую диссеминацию в доклинических моделях рака простаты.

Исследование парных образцов до и после лечения методом scRNA-seq показало практически универсальное обогащение генов аксонального наведения в CAF после химиотерапии. Нейрональные CAF ассоциированы с периневральной инвазией, повышенной пролиферацией опухоли и метастатическим рецидивом PDAC.

Интегративный пространственно-транскриптомный анализ выявил специфическую для MSS КРР глиально-tip-клеточную нишу на границе опухоли, ассоциированную с полным эпителиально-мезенхимальным переходом (EMT-II) и резистентностью к иммунотерапии. Разработанная сигнатура TiGELR позволяет стратифицировать пациентов по MSS/MSI-статусу и прогнозировать ответ на ингибиторы контрольных точек.

Исследование показало, что мощный противовирусный иммунный ответ на онколитический вирус подавляет противоопухолевый Т-клеточный ответ. Вирусы, экспрессирующие опухолевые антигены или их измененные варианты (APL), способны преодолеть центральную толерантность и индуцировать эффективный противоопухолевый иммунитет даже в присутствии доминирующего антивирусного ответа.

Серийная 3D-реконструкция >25 000 флуоресцентно меченых клонов кератиноцитов в модели плоскоклеточного рака кожи показала, что появлению драйверных мутаций предшествует формирование гигантских клонов (goliath clades, >500 клеток). Только 2 из 21 отслеженного гиганта развились в видимые опухоли, что объясняет редкость рака на фоне высокой соматической мозаичности.

Исследование выявило митотическую киназу BUB1B как ключевой драйвер кастрационно-резистентного рака предстательной железы (КРPC). Фосфорилирование субстрата BUB1B — белка CENP-E — необходимо и достаточно для прогрессии КРPC независимо от AR-сигнализации. Ингибитор CENP-E GSK923295 сенсибилизирует резистентные клетки к энзалутамиду и подавляет рост энзалутамид-резистентных ксенографтов in vivo.

Обзор данных о связи герминальных патогенных вариантов в генах предрасположенности к РМЖ с паттерном метастазирования: от BRCA1 до современных моделей взаимодействия опухоли и микроокружения.